A) Libros

            1. Ciencia y metafísica en el Kant precrítico (1746-1765). Una contribución a la historia de las relaciones entre ciencia y filosofía en el siglo XVIII. Sevilla, Secretariado de Publicaciones de la Universidad de Sevilla, 1982. 212 pp. ISBN: 84-7405-216-5.
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            2. Apariencia y Verdad. Estudio sobre la filosofía de P.L.M. de Maupertuis (1698-1759). Buenos Aires, Editorial Charcas, 1990. 321 pp. ISBN: 950-9110-03-07.
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            3. El centro del laberinto. Los motivos filosóficos en la obra de Borges. Pamplona, Eunsa, Colección biblioteca «NT». 1994, 183 pp. ISBN: 84-313-1275-0.
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            4. La mecánica y el espíritu. Leonhard Euler y los orígenes del dualismo contemporáneo, Madrid, Editorial Complutense, col. Philosophica Complutensia, 1994, 231 págs. ISBN: 84-7491-517-1.
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            5. Claves del conocimiento del mundo. 1. Materia y movimiento, Sevilla, Ed. Kronos, col. Kronos Universidad, 1996; 2ª ed.: 1997; 3ª ed.: 1999, 307 pp. ISBN: 84-88620-70-5.
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            6. Las raíces ilustradas del conflicto entre fe y razón, Madrid, Ediciones Encuentro, col. Ensayos, 1999, 199 pp. ISBN: 84-7490-562-2
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            7. Claves del conocimiento del mundo. 2. Universo y vida, Sevilla, Ed. Kronos, col. Kronos Universidad, 2000, ISBN: 84-85101-26-X, 355 pp.
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            8. La eternidad de lo efímero. Ensayos sobre Jorge Luis Borges, Madrid, Ed. Ciencia Nueva, col. Ensayos, 2000, 155 pp. ISBN: 84-7030-858-0.
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            9. Materia, Universo, Vida, Madrid, Tecnos, col. Ventana Abierta, 2001, 2ª edición: 2002, 570 pp. ISBN: 84-309-3837-0.
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            10. El Dios sin rostro. Presencia del panteísmo en el pensamiento del siglo XX, Madrid, Biblioteca Nueva, col. Ensayos, 2003, 140 pp. ISBN: 84-9742-192-2.
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            11. El caos del conocimiento. Del árbol de las ciencias a la maraña del saber, Pamplona, Eunsa, 2004. 124 pp. ISBN: 84-313-2157-1.
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            12.- Los filósofos y la libertad. Necesidad natural y autonomía de la libertad, Madrid, Síntesis, colección Hermeneia, 2005, 256 pp. ISBN: 84-9756-327-1.
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            13.- Filosofía de lo cotidiano. Hojas de calendario, Madrid, Biblioteca Nueva, 2005, 126 pp. ISBN: 84-9742-469-7.
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B) Traducciones y ediciones

            1. Traducción, estudio crítico y comentario perpetuo de: Immanuel Kant: Pensamientos sobre la verdadera estimación de las fuerzas vivas (1747). Bern, Peter Lang Verlag, 1988. ISBN: 3-261-03544-7. 476 págs.
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            2. Traducción, estudio preliminar y notas (la traducción, en colaboración con Marcelino Rodríguez Donís) a: Gottfried Wilhelm Leibniz, Escritos de dinámica, Madrid, Tecnos, Colección «Clásicos del pensamiento», 1991, ISBN: 84-309-2020-X. LVII + 130 págs.
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            3. Matías Nieto Serrano, El sistema de la ciencia viviente. Antología filosófica, Introducción, selección y notas de Juan Arana, Pamplona, Cuadernos del Anuario Filosófico, Serie de Filosofía Española, 1997, ISSN: 1138-3232, 122 pp.
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            4. Erwin Schrödinger, La nueva mecánica ondulatoria y otros escritos, Edición y estudio introductorio de Juan Arana, Madrid, Biblioteca Nueva, 2001. ISBN: 84-7030-956-0. Traducción de Xavier Zubiri y Juan Arana. 117 pp.
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            5. Nicolás Gómez Dávila, Escolios escogidos, Prólogo y edición de Juan Arana, Sevilla, Papeles del Sitio, 2007. ISBN: 978-84-935892-I-9. 205 pp.
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